في حال عدم استجابة جرثومة المعدة للعلاج بعد اتباع المدة المطلوبه اسبوعين كاملين بدون توقف للمضادات وعلاج المعدة يعني ثلاثة علاجات التي ذكرها زميلي ثم اسبوعين على علاج المعده فقط بعدها راحه اسبوع بدون اي علاجات ثم تقوم بعمل التحليل يفضل تحليل بالتنفس لانه ذو تدقيق عالي
الجرثومه يمكن ان تحتاج الى ثلاثة كورسات للعلاج ولا تنتهي من اول كورس ونراعي المرات التاليه ان نغير من علاج كلارثروميسين لوجود مقاومه عاليه عليه
في حال لم تنتهي بعد ثلاثة كورسات علاج قد تحتاج الى منظار جهاز هضمي للتأكد من وجود تقرحات معها تمنع استجابتها للعلاج