تحتاج الفطريات كباقى الكائنات الحيه الى مصادر للطاقة لادامة الفعاليات الحيويه التى تقوم بها و بما ان الفطريات لا تمتلك مادةالكلورفيل الخضراء Chlorophyll التى تساعد فى عملية صناعة الغذاء فى النباتات لذالك فإنها لا تستطيع أن تصنع غذائها بنفسها و تحتاج إلى مصادر خارجية مختلفه للحصول على الغذاء لذلك تعتبر الفطريات متعددة التغذيةHeterotrophic.
تسمى طريقة تغذية الفطريات بصورة عامة بالتغذية الامتصاصية Absorptive mod of nutrition أي أنها ترسل الإنزيمات إلى المحيط التي تعيش فيه Substrate فتفكك هذه الإنزيمات المواد الغذائية إلى مكوناتها البسيطة ثم تقوم بامتصاصها تختلف الفطريات باختلاف أنواعها في حاجاتها إلى نوعية المواد الغذائية.
لقد ذكر Alexopoulosالكسي 1996ان بعض الفطريات تستطيع أن تعيش في أي مكان وتتغذى على جميع انواع لخلايا النباتيه او الحيوانيه او المجهريه الحيه وكذالك تستطيع ان تعيش على المواد العضويه وعلى الخلايا الحيه الميته وتستطيع ان تأكل كل شىء أي Omnivorous من مربى التفاح إلى جلد الحذاء إذا توفرت لها الحرارة والرطوبة المناسبتين ولكن هناك أيضاً بعض الفطريات متخصصة في معيشتها نوع معين من الانسجه او المواد او على عائل واحد Host نباتي أو حيواني كما في عائلة Family الفطريات Peronosporaceae التي تسبب مرض البياض الزغبي Downey mildewلمدى واسع من النباتات حيث يكون كل نوع من فطريات هذه العائله متخصص لاصابة نوع معين من النباتات كما هناك بعض الفطريات التي تتخصص بإصابة جزء واحد أو منطقة واحدة من النبات أو الحيوان كما في الفطريات التي تعيش على المنطقة المتقرنة من جسم الإنسان كالشعر والأظافر والطبقه الخارجيه السطحيه من الجلد ولكن الفطريات بصورة عامة تحتاج الى مصدر للطاقة أو الكربوهيدرات وخاصة الكلولوز أو السكروز والمالتوز وعلى الرغم من أكثر الفطريات تستطيع أن تصنع البروتين بنفسها بتحويل المواد غير العضوية إلى مواد عضوية فإن هناك المواد بعض العناصر الضرورية التى الفطريات على تصنيعها مثل العناصر التالية
C,O,H,P,K,Mg,S,B,Mn,Cu,Mo,Fe, AND Zn
كما هناك بعض الفطريات تحتاج إلى عناصر محددة دون غيرها كما هناك بعض الفطريات التي تستطيع أن تنتج بعض الإنزيمات المفككة لبعض المواد الغذائية إلى عناصر أقل ليسهل امتصاصها مثلProtinase & Pectinase ولأن التغذية في الفطريات امتصاصية أي أن الفطر يعيش خارج الخلية ويرسل الإنزيمات إلى داخل الخلية لتفكيكها ثم امتصاصها لذلك يعتبر من الكائنات الحية التي معدتها خارج جسمها وتقسم التغذية في الفطريات إلى ثلاثة أقسام هي:
التغذية الطفيلية nutrition Parasitism
ويسمى الكائن الحي بالطفيل Parasite(الكائن الحي الذي يعيش في أو على كائن حي آخر يختلف عنه في التصنيف ويقضي كل أو جزء من حياته ويحصل على كل أو جزء من غذائه ويسبب له تغيرات فسيولوجية أو مورفولوجية ممكن أن تؤدي إلى الموت) والتغذية الطفيلية هي أن تعيش الفطريات على الخلايا الحية كأن تكون نباتات أو حيوانات او اية خلية حية حيث أن الفطريات تهاجمها وتعيش فيها او عليها وتسبب لها تغيرات فسيولوجية او مورفولوجية ممكن أن تكون قاتلة فمثلاً الفطريات Histoplasm sp & Candida sp تهاجم الإنسان وتسبب له أمراض خطيرة في حين يهاجم الفطرOphiostom sp نبات الدردار الألماني وقد قتل هذا الفطر ما يقارب نصف أشجار ثمار أمريكيا في عام 1930 والتغذية الطفيلية إما أن تكون إجبارية Parasitism Obligate أي أن الفطر لا يستطيع أن يعيش إلا على الخلية الحية وتسمى إجبارية التطفل وعندما يكون التطفل على الخلية النباتية يسمى Biotrophy أو يكون التطفل اختيارى ويسمى اختيارية التطفل Facultative Parasitism أي أنه يعيش على الخلية الحية وبعد موتها يعيش على بقايا المواد العضوية.
التغذية الرمية nutrition Saprophytism
ويسمى الفطر الذى يتغذى رميا Saporbe, Sapophyte وهي أن الفطر يعيش على المواد العضوية أو الميتة وكذلك على البيئات الصناعية مما يسهل إمكانية دراسته في المختبرات البايولوجية ويقسم أيضاً إلى قسمين إجباري الترممObligate saprophytisim أي أن الفطر لا يستطيع أن يعيش إلا على المواد الميتة مثل Silobolus sp & Chaetonium sp أو اختيار الترمم Saprophytisim facultative أي أن الفطر يستطيع أن يعيش على الخلايا الحية وبعد موتها يستطيع أن يستمر في حياته على بقايا المواد الميته العضوية مثل Pythium sp & Fusarium sp.
التغذية التكافيلية Symbiosism nutrition
او تبادل منفعة ويسمى الفطر متعايش Commensal أو Symbiosis وفيها يعيش الفطر في علاقة اتحاد او تبادل منفعة مع كائن حي آخر كالطحالب ليكون الاشنات Lichens (التى تتكون من فطر وطحلب) او علاقة والمايكورايزا Mycorriza
حيث يقوم النبات بتزويد الفطر بالغذاء ويقوم الفطر بتزويد النبات ببعض العناصر او المود التى يحتاجها النبات أي تبادل منفعة دون إحداث ضرر أحدهما للآخر كما في حالة الاشنات والتي هي عبارة عن طحلب وفطر حيث يقوم الفطر بتزويد الطحلب ببعض المواد والعناصر التي يحتاجها ويقوم الطحلب بالتراكيب الضوئي ويزود الفطر بالغذاء ودون إحداث أي ضرر أحدهما للآخر كما توجد هناك عدة أنواع من العلاقات بين الفطريات وبعض الكائنات الأخرى حيث تعيش بعض الفطريات في داخل أجسام الإنسان أو الحيوان أو الحشرات دون أن تسبب أي أذى في حين أن بعضها ينصب شرك للحشرات ثم يصادها ويقتلها ويتغذى عليها وتسمى هذه الفطريات المفترسات Predacious فطريات أخر كما هناك بعض الفطريات التي تتغذى على فطريات أخر وتسمى Mycoparasite